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              Affymetrix芯片服务平台

              Affymetrix GeneChip生物芯片检测系统, 是由高密度GeneChip芯片和试剂, 杂交扫描仪器,数据处理和分析工具组成的一整套检测平台, 是世界上第一种经欧盟和美国FDA审批的可用作体外诊断的芯片系统。

              Affymetrix芯片技术特点

              Affymetrix 芯片服务平台一览

               

              一基因组层次研究服务: 

               Affymetrix SNP分型芯片服务

              芯片名称

              芯片信息

              Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0

              该芯片涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物:包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化(CNVCopy Number Variation)的探针

              Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

              这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似既包含SNP探针也包含CNV探针。一共涵盖623,124个SNP位点和916,269个CNV探针。

              Affymetrix GeneChip Rice 44K SNP Genotyping Array

              芯片覆盖indica, aus, tropical japonica, temperate japonica, and group V (“aromatic”)多个水稻亚种的44,1000个SNP。 每10kb至少包括1个SNP每个SNP设计12个探针技术重复相关系数R2 > 99%。

              二转录组层次研究服务: 

               Affymetrix基因表达谱芯片服务

              芯片名称

              芯片信息

              Affymetrix GeneChip® Human Genome U133 Plus 2.0 Array

              该芯片包含了47,000个转录本,代表了38,500个明晰的人类基因。数据库来源于GeneBankdbESTRefSeqUniGene databaseWashington University EST trace repositoryNCBI human genome assembly。

              Affymetrix GeneChip Human Transcriptome Array 2.0

              最高分辨率的基因芯片支持所有转录本异构体的全转录组分析包含超过六百万条不同探针覆盖编码和非编码转录本。

              该芯片为每个外显子设计约10条探针,每个外显子之间的剪接点有4条探针,确保每个实验都能获得完整准确和可重复的数据。重复性高(批内相关系数≥0.99),所有检测过的组织观察到的变异系数(CV)<6.5%。样品类型既包括新鲜冻存样品,也包括FFPE 样本。

              Affymetrix GeneChip Human Gene 2.0ST Array

              Affymetrix新一代全转录本芯片在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA 与上一代1.0 ST Array相比2.0 ST Array有更多的优点:全面覆盖转录组可以同时检测>30,000个编码的转录本和>11,000个长链非编码转录本;探针设计最大程度覆盖所有外显子可检测选择性拼接/转录本变体。每个转录本覆盖特异探针的数目中值达到21种每种探针的长度为25bp这意味着每个转录本将被检测的碱基数中值高达525个;重复性高;灵敏度高。

              Affymetrix GeneChip Mouse Gene 2.0 ST Array(

              Affymetrix新一代全转录本芯片在一张芯片上可以同时检测mRNA和lincRNA 与上一代1.0 ST Array相比2.0 ST Array有更多的优点:全面覆盖转录组可以同时检测35,240个编码的转录本和>2,000个lincRNA;探针设计最大程度覆盖所有外显子;重复性高;灵敏度高。

              Affymetrix GeneChip Mouse Genome 430 2.0 Array

              该芯片涵盖了39,000个转录本,代表34,000个明晰的小鼠基因。序列信息基于GeneBankdbESTRefSeqUniGene database。 

              Affymetrix GeneChip Rat Genome 230 2.0 Array

              该芯片包含有31,000个probe sets代表28,000个明晰的大鼠基因。序列信息基于GenBank , dbEST, RefSeq等权威数据库。 

               Affymetrix miRNA芯片服务

              芯片名称

              芯片信息

              Affymetrix miRNA 4.0 Arrary

              100% 覆盖miRBase v20数据库,同时检测203个物种的miRNA,信息量大-芯片结果包括:host gene IDmiRNA target genesclustered miRNA等

              Affymetrix miRNA 3.0 Arrary

              含盖Sanger miRBase V17.0数据库同时检测153个物种的miRNA同时检测成熟miRNA和miRNA前体能检测人snoRNA和scaRNA

              技术支持

              电话021-57072092
              Email:service6@sangon.com