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              DNase I footprinting assay(DNase I足迹分析实验)

              服务简介

              DNase I footprinting是一种精确鉴定DNA结合蛋白(如转录调控蛋白)在DNA分子上的结合位点的检测方法。转录调控蛋白通过与启动子区域结合来调控靶标基因的转录。目前,凝胶阻滞实验(EMSA)和DNase I足迹分析实验是重要的一套体外研究工具:凝胶阻滞实验可以确定转录因子是否与DNA直接结合,而DNase I足迹分析实验则可以精确鉴定其结合的DNA序列,从而帮助我们研究基因转录调控的机制。经典的DNase I足迹分析实验需要使用同位素进行标记,不仅危险,而且费时对操作者的技术要求高成功率低。针对这种情况,本公司利用“荧光标记”结合ABI测序仪的方法来进行DNase I足迹分析实验。优点是:由于可以进行DNA的精确定量,并可以在常规的实验台上面操作;可重复性要远远好于同位素操作;ABI测序仪的操作体系非常成熟,灵敏度高,重复性好。因此,荧光标记法更灵敏度,获得的保护区域更清晰,图片的质量更好。

              主要流程

              蛋白与探针结合 DNase I梯度酶切 ABI测序仪检测 确定检出的蛋白保护序列

              订购信息

              服务项目

              说明

              周期

              报价

              探针制备及与蛋白结合

              客户提供准确的DNA结合蛋白的序列范围序列或根据文献设计探针合成

              1~2周

              详细

              DNase I梯度酶切

              需要进行反复摸索条件达到对DNA部分酶切的效果

              1~2周

              ABI测序仪检测

              检测结果进行图片与数据处理确定检出的蛋白保护序列并提供可发表图片。

              3~5个工作日

              客户提供

              提供样品
              1) 纯化的蛋白;
              提供信息
              1) DNA样品及引物序列;
              2) 提供EMSA结果图及实验参数以便于接下来的DNase I足迹分析实验。
              交付结果
              1) 原始数据、结果图片
              2) 完整的实验报告(含实验步骤、流程及试剂耗材厂家)